Ústav experimentální
botaniky AV ČR, v.v.i.
O nás
Výzkumné skupiny
Volná místa
Výuka
Novinky
Média
Kontakty
Zaměstnanci
cz
en
Domů
Volná místa
Mapování regulátorů transkripce v embryu ječmene
Mapování regulátorů transkripce v embryu ječmene
Kategorie
Vysokoškoláci
Skupina
Skupina Šimková
Určeno magisterským studentům se začátkem studia v roce 2020
Popis
Téma a cíle:
Genová exprese v různých typech buněk je řízena souhrou transkripčních faktorů a nekódujících regulačních elementů, zejména promotorů a enhancerů.
Enhancery (zesilovače) lze v genomu nalézt za pomoci transkriptomických a epigenomických technik, zejména ChIP-seq a ATAC-seq.
Diplomová práce pomůže objasnit procesy řídící vývoj zrna u obilovin.
Náplň práce:
Preparace embryí v různých stádiích vývoje
Analýza chromatinu metodami ChIP-seq a ATAC-seq
Základní bioinformatické zpracování získaných dat
Školitelé:
Mgr. Pavla Navrátilová, Ph.D.
Ing. Hana Šimková, CSc.