Funkční analýza regulátorů transkripce v genomu ječmene

Téma a cíle:

• Genová exprese v různých typech buněk je řízena souhrou transkripčních faktorů a nekódujících regulačních elementů, zejména promotorů a vzdálených zesilovačů (enhancerů) a zeslabovačů (silencerů)
• V předchozí studii jsme predikovali tisíce vzdálených regulátorů v genomu ječmene
• Cílem diplomové práce je provést funkční validaci vybraných silencerů/enhancerů pomocí reportérového testu
• Diplomová práce pomůže objasnit procesy řídící vývoj zrna a klíčení u obilovin a vybrat cíle pro úpravy genomu technikami genového inženýrství

Náplň práce:

• Příprava protoplastů z klíčících rostlin ječmene
• Příprava konstruktů s regulačním elementem pro transformaci protoplastů
• Luciferázový reportérový test a vyhodnocení

Školitelé:

Mgr. Zuzana Tulpová, Ph.D.